42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2271 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  348  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  95.04 
 
 
172 aa  261  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  67.61 
 
 
171 aa  204  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  53.94 
 
 
178 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  54.94 
 
 
178 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  58.22 
 
 
180 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  56.69 
 
 
314 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  58.62 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  58.62 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  57.48 
 
 
171 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  56.69 
 
 
171 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  56.76 
 
 
183 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  57.53 
 
 
181 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  41.32 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  39.73 
 
 
162 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  40.48 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  43.18 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  42.31 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  34.78 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  35.78 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  36.56 
 
 
138 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  34.48 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  34.29 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  31.43 
 
 
210 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  28.32 
 
 
231 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  34.82 
 
 
189 aa  47.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  31.21 
 
 
221 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  30.2 
 
 
183 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  27.17 
 
 
228 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  28.74 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  27.52 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  25.16 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  27.33 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  27.33 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  27.4 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3388  hypothetical protein  28.36 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1124  hypothetical protein  29.69 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  27.34 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  28.91 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.04 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  27.66 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>