25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0522 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0522  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0565289  normal  0.869934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  93.29 
 
 
202 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  72.48 
 
 
202 aa  227  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  58.67 
 
 
191 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  55.7 
 
 
190 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  51.83 
 
 
250 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  51.83 
 
 
269 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  51.83 
 
 
269 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  51.83 
 
 
269 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  51.83 
 
 
269 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  51.83 
 
 
269 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  51.83 
 
 
301 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  55.03 
 
 
190 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  50.61 
 
 
237 aa  168  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  55.03 
 
 
190 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  55.03 
 
 
200 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  55.03 
 
 
200 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  55.03 
 
 
190 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  38.06 
 
 
189 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  37.42 
 
 
179 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  39.35 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  34.38 
 
 
229 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  35.85 
 
 
198 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  29.58 
 
 
173 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  29.68 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>