24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5801 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5801  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.558099  normal  0.179453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0980  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  81.67 
 
 		 262 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615831 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3411  carboxymuconolactone decarboxylase  61 
 
 		 250 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3248  carboxymuconolactone decarboxylase  54.69 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0991  putative gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  43.62 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7140  carboxymuconolactone decarboxylase  40.83 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0317  hypothetical protein  30.73 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.388122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3953  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.06 
 
 		 131 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3840  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.06 
 
 		 131 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4714  carboxymuconolactone decarboxylase  42.61 
 
 		 135 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0927344  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7418  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit  26.46 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0051102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1467  hypothetical protein  26.11 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  31.3 
 
 		 116 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  25.93 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  47.62 
 
 		 115 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 		 100 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  30.63 
 
 		 115 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  31.58 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  43.55 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.07 
 
 		 114 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0351  carboxymuconolactone decarboxylase domain-containing protein  39.47 
 
 		 108 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.4 
 
 		 112 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  41.94 
 
 		 114 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  41.94 
 
 		 117 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>