59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2750 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  70.99 
 
 
131 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  70.99 
 
 
131 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  67.21 
 
 
129 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  67.21 
 
 
129 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  67.21 
 
 
129 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  67.21 
 
 
129 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  67.21 
 
 
129 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  67.21 
 
 
129 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  66.39 
 
 
129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  67.21 
 
 
129 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  54.96 
 
 
130 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  53.44 
 
 
130 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  53.44 
 
 
130 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  53.44 
 
 
130 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  52.67 
 
 
130 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  52.67 
 
 
130 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  54.96 
 
 
130 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  56.25 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  55.36 
 
 
124 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  55.36 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  52.63 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  49.55 
 
 
129 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  44.74 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  47.12 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  41.96 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  30.41 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  43.88 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0933  membrane protein-like protein  33.08 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  39.05 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  32.06 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  32.81 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  35.71 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  35.71 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  34.82 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0827  hypothetical protein  30.83 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1785  membrane protein-like  30.08 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  35.78 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  32.52 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  36.7 
 
 
125 aa  59.3  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  36.36 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  37.61 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0812  membrane protein-like  33.98 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  32 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  39.68 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  35.9 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2954  putative transmembrane protein  26.77 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  35 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  24.79 
 
 
122 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1178  putative transmembrane protein  30 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  28.93 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  30.93 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  27.35 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  26.5 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  30.77 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0704  putative transmembrane protein  35.71 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231746  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5551  putative transmembrane protein  32.14 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>