More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2305 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2305  methyltransferase type 11  100 
 
 
341 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375936 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  42.79 
 
 
524 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3840  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.598464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.17 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.83 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0743  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.999893  normal  0.843892 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1815  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  32.65 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  33.99 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
218 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.83 
 
 
237 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 
272 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
237 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  36.97 
 
 
233 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.67 
 
 
242 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
237 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.37 
 
 
251 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.37 
 
 
251 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
249 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.87 
 
 
201 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.37 
 
 
251 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0667  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 
241 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605839  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 
241 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
204 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
201 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 
262 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.67 
 
 
251 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.67 
 
 
251 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.67 
 
 
251 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.04 
 
 
261 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  36.04 
 
 
261 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.67 
 
 
251 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
237 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
204 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  32.33 
 
 
287 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
204 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.46 
 
 
245 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  28.79 
 
 
168 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0567  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.21 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.26 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  35 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  30.17 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.84 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
204 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
204 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  33.61 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
258 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
204 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.28 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
243 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  35.19 
 
 
253 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
237 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.25 
 
 
241 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.11 
 
 
236 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
204 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
204 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
215 aa  53.1  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  35.24 
 
 
204 aa  53.1  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  28.67 
 
 
271 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.5 
 
 
420 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.17 
 
 
213 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
276 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  33.61 
 
 
273 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
206 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
202 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.66 
 
 
236 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.56 
 
 
235 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0894  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000138444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.47 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>