28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1088 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  66.32 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  39.37 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  36.65 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  31.34 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  24.45 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  27.34 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  25.09 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  24.63 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  25.09 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  27.52 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  23.72 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  23.72 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  24.48 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  25.18 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  23.22 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  27.46 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  25.09 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  25.09 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  23.88 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  24.3 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  30.97 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  27.54 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  27.54 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  28.97 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  28.83 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  28.97 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>