22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0920 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0920  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  921    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0545  hypothetical protein  31.4 
 
 
701 aa  170  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  24.78 
 
 
454 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.87 
 
 
412 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1460  type I restriction-modification system, S subunit, putative  21.3 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  24.54 
 
 
473 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3599  hypothetical protein  22.96 
 
 
482 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  37.5 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20390  hypothetical protein  31.03 
 
 
471 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.123185  normal  0.078354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 
1362 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  26.71 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.23 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1148  hypothetical protein  23.14 
 
 
427 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00179115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.95 
 
 
401 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  26.67 
 
 
405 aa  50.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2173  hypothetical protein  27.34 
 
 
177 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11275  normal  0.026924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  28.08 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.81 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
419 aa  47  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5291  hypothetical protein  20.96 
 
 
555 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.673527  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  28.97 
 
 
730 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  19.58 
 
 
393 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>