38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0638 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0638  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5987  cupin domain-containing protein  88.35 
 
 
103 aa  187  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2688  cupin 2 domain-containing protein  86.41 
 
 
103 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2580  cupin 2 domain-containing protein  85.44 
 
 
103 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2659  cupin 2 domain-containing protein  86.41 
 
 
103 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2706  cupin 2 domain-containing protein  85.44 
 
 
103 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2048  cupin 2, barrel  86.41 
 
 
103 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4719  cupin domain-containing protein  81.55 
 
 
103 aa  183  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.0255317 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  79.61 
 
 
203 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5970  Cupin 2 conserved barrel domain protein  81.55 
 
 
103 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374591  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  79.61 
 
 
105 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  79.61 
 
 
120 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  79.61 
 
 
120 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  79.61 
 
 
120 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  79.61 
 
 
103 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2206  hypothetical protein  79.61 
 
 
121 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.747866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0633  hypothetical protein  76.7 
 
 
120 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.641228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1663  hypothetical protein  74.76 
 
 
103 aa  166  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231428  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  75.73 
 
 
103 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1238  cyclic nucleotide-binding protein  75.73 
 
 
103 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103405  normal  0.772826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  72.55 
 
 
103 aa  163  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0481  hypothetical protein  73.79 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0656  cupin 2 domain-containing protein  70.87 
 
 
103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2050  DSBH domain-containing protein  65.05 
 
 
103 aa  153  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16440  hypothetical protein  60.19 
 
 
103 aa  130  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2431  hypothetical protein  57.28 
 
 
103 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1271  cupin 2 domain-containing protein  63.27 
 
 
103 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.113842  hitchhiker  0.00655091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1160  cupin 2, barrel  59.62 
 
 
104 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677962  decreased coverage  0.00806774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0253  hypothetical protein  71.15 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  35.87 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2052  cyclic nucleotide-binding protein  34.74 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0843968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6454  cyclic nucleotide-binding protein  34.41 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.0803587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  27.96 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  27.47 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
128 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>