35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3614 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  100 
 
 		 177 aa  340  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  36.72 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3064  hypothetical protein  38.37 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0822  hypothetical protein  31.98 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  33.53 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5814  recombination regulator RecX  29.22 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4526  recombination regulator RecX  30.33 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  30.81 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  36.28 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4261  recombination regulator RecX  28.69 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1418  hypothetical protein  29.46 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  35.09 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  34.51 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  31.09 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  29.78 
 
 		 254 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  31.36 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 338 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  34.75 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  38.79 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  28.48 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  33.01 
 
 		 200 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  33.04 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  33.93 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  36.04 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.15 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0520  regulatory protein RecX  36.19 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  25.83 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  31.86 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  28.07 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 127 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  29.6 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  29.6 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  27.45 
 
 		 168 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  29.46 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  30 
 
 		 198 aa  40.8  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>