25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3149 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3149  ferredoxin  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0232  ferredoxin, 2Fe-2S  64.46 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1916  ferredoxin  58.27 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1751  putative 2Fe-2S ferredoxin protein  56.67 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0397  ferredoxin  56.67 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2499  ferredoxin  56.67 
 
 		 122 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.809791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1188  ferredoxin  56.45 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000641343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39700  Ferredoxin  54.17 
 
 		 122 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2342  ferredoxin  53.91 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  54.24 
 
 		 302 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  53.39 
 
 		 301 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  49.23 
 
 		 302 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  51.69 
 
 		 301 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1519  ferredoxin  55.65 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1237  ferredoxin  55.65 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0193309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3778  ferredoxin  46.67 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1449  ferredoxin  51.69 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0287  ferredoxin  44.17 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0545  ferredoxin  36.75 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1236  ferredoxin  32.08 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0203128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1518  ferredoxin, putative  32.08 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0846747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.07 
 
 		 328 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49401  predicted protein  48.57 
 
 		 140 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.97 
 
 		 625 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4547  ferredoxin  28.89 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>