More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2859 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  59.7 
 
 
540 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
539 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
540 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  57.2 
 
 
539 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  57.94 
 
 
539 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  70.93 
 
 
542 aa  802    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  60 
 
 
541 aa  691    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 
542 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  60.34 
 
 
541 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  65.86 
 
 
542 aa  742    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  56.61 
 
 
546 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  61 
 
 
541 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  57.09 
 
 
541 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  56.77 
 
 
534 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  57.01 
 
 
541 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 
542 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  59.22 
 
 
541 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 
542 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
539 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
540 aa  1113    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  57.36 
 
 
545 aa  648    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  70.93 
 
 
542 aa  802    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  59.4 
 
 
541 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  71.3 
 
 
569 aa  802    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  55.85 
 
 
539 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  55.66 
 
 
539 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  56.07 
 
 
541 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  56.07 
 
 
541 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  56.07 
 
 
541 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  54.94 
 
 
524 aa  612  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.62 
 
 
536 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  58.27 
 
 
541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  55.47 
 
 
560 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  55.05 
 
 
526 aa  601  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  42.92 
 
 
588 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.8 
 
 
479 aa  243  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.8 
 
 
479 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.8 
 
 
479 aa  243  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.8 
 
 
479 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.8 
 
 
479 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.8 
 
 
479 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.8 
 
 
479 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.04 
 
 
466 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 
479 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 
479 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.34 
 
 
477 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  32.34 
 
 
479 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  32.11 
 
 
479 aa  233  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  32.8 
 
 
476 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.11 
 
 
471 aa  226  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.73 
 
 
457 aa  220  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.16 
 
 
475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.04 
 
 
482 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.35 
 
 
482 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.48 
 
 
475 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.9 
 
 
477 aa  211  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.08 
 
 
472 aa  203  6e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  34.6 
 
 
482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  29.74 
 
 
499 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  28.89 
 
 
475 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.63 
 
 
489 aa  170  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  28.73 
 
 
468 aa  170  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.6 
 
 
485 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  27.96 
 
 
464 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3221  aldehyde dehydrogenase  29.09 
 
 
488 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132306  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  29.31 
 
 
478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  28.79 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  28.76 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.42 
 
 
474 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  27.73 
 
 
465 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  27.65 
 
 
484 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  28.42 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  28.42 
 
 
474 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.42 
 
 
474 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  28.42 
 
 
474 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  28.42 
 
 
474 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  28.01 
 
 
474 aa  163  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  29.65 
 
 
480 aa  163  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.04 
 
 
484 aa  163  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2217  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.9 
 
 
488 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  27.31 
 
 
484 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  26.73 
 
 
484 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  28.04 
 
 
484 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  28.7 
 
 
484 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  28.87 
 
 
489 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3004  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  29 
 
 
486 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  27.84 
 
 
457 aa  161  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2373  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  29 
 
 
486 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2193  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  29 
 
 
486 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2130  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  29 
 
 
486 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000408712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2354  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  29 
 
 
486 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2320  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  28.77 
 
 
486 aa  160  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  28.54 
 
 
475 aa  160  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.21 
 
 
484 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.21 
 
 
484 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  28.89 
 
 
485 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1729  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
486 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  28.04 
 
 
477 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  27.81 
 
 
484 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>