59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2774 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.68 
 
 		 139 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.92 
 
 		 143 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.96 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.01 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.52 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.62 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.29 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.51 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.09 
 
 		 139 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.3 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.59 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.32 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.62 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.02 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0129  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.14 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.63 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  36.92 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.08 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.87 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  23.26 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.04 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.38 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.29 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.21 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.68 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.52 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.62 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.27 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.15 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.21 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35127  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  33.33 
 
 		 170 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>