More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1820 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  72.14 
 
 
463 aa  690    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  72.35 
 
 
463 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  87.26 
 
 
477 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1820  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
463 aa  940    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935448  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  67.39 
 
 
463 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  72.35 
 
 
463 aa  690    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  72.14 
 
 
463 aa  689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1223  Aldehyde Dehydrogenase  75.81 
 
 
462 aa  705    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  76.03 
 
 
463 aa  733    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  72.14 
 
 
463 aa  690    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  82.72 
 
 
463 aa  765    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  80.99 
 
 
463 aa  775    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2032  aldehyde dehydrogenase  75.59 
 
 
460 aa  701    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  72.57 
 
 
463 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  58.7 
 
 
463 aa  568  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  55.1 
 
 
526 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  51.41 
 
 
460 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  52.4 
 
 
456 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  50.54 
 
 
460 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  48.47 
 
 
456 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  47.03 
 
 
458 aa  428  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
470 aa  425  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0488  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 
468 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.627083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.71 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  47.14 
 
 
485 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.48 
 
 
456 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
457 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.48 
 
 
456 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.7 
 
 
456 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.48 
 
 
456 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  47.26 
 
 
456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  44.37 
 
 
457 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  45.15 
 
 
466 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
452 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
463 aa  393  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  43.83 
 
 
466 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  42.6 
 
 
487 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  43.87 
 
 
464 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
454 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  45.25 
 
 
452 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.54 
 
 
465 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  45.05 
 
 
455 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  44.84 
 
 
455 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  43.83 
 
 
454 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  43.33 
 
 
455 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.89 
 
 
454 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07850  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  43.2 
 
 
454 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  41.3 
 
 
460 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
469 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  43.58 
 
 
458 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1103  Aldehyde Dehydrogenase  44.52 
 
 
450 aa  349  8e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  41.36 
 
 
465 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
511 aa  346  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  42.32 
 
 
454 aa  346  5e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 
459 aa  346  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.32 
 
 
455 aa  346  6e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  42.51 
 
 
469 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  42.23 
 
 
469 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  40.09 
 
 
452 aa  345  8.999999999999999e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
469 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  41.18 
 
 
458 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
455 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1844  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
453 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434282  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2216  Aldehyde Dehydrogenase  41.19 
 
 
474 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273207  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  38.8 
 
 
457 aa  339  5e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 
452 aa  339  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  40.53 
 
 
451 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  39 
 
 
457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
449 aa  336  5e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
452 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  43.11 
 
 
455 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 
454 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  38.55 
 
 
457 aa  328  8e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 
461 aa  328  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.01 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3843  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.48 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0914  aldehyde dehydrogenase  37.33 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10340  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
461 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
470 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
459 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
462 aa  325  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
462 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
462 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
462 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
462 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.67 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  37.39 
 
 
460 aa  319  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 
456 aa  319  6e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  36.32 
 
 
457 aa  316  5e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2797  Aldehyde Dehydrogenase  40.43 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  39.34 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  37.22 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>