More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1911 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.72 
 
 		 462 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 458 aa  941    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.03 
 
 		 473 aa  558  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  56.73 
 
 		 459 aa  551  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1446  aldehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  0.248948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  44.3 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  44.18 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  44.86 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  43.54 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  45.37 
 
 		 457 aa  415  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  43.98 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  42.04 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  43.11 
 
 		 460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  45.37 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  43.17 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  43.42 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  42.6 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  42.83 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.48 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  43.89 
 
 		 475 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  41.5 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  41.37 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  43.64 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 456 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  41.94 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  44.05 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  41.06 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.04 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.71 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  42.2 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  41.76 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2005  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 462 aa  362  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  41.28 
 
 		 461 aa  362  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.36 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.63 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 462 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1642  adenylosuccinate lyase  41.36 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  39.38 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  39.3 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  39.07 
 
 		 455 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  39.07 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  39.07 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  38.92 
 
 		 464 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 462 aa  359  7e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  42.41 
 
 		 462 aa  359  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  42.41 
 
 		 462 aa  359  7e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.85 
 
 		 456 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 462 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.85 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.96 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  40.44 
 
 		 463 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.63 
 
 		 456 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.63 
 
 		 456 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 511 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  40.35 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  41.52 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.41 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 526 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.96 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 461 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  39.51 
 
 		 455 aa  353  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 463 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2202  Aldehyde Dehydrogenase  42.16 
 
 		 456 aa  351  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2797  Aldehyde Dehydrogenase  41.92 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.34 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  39.96 
 
 		 469 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 452 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  39.82 
 
 		 469 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  39.47 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2216  Aldehyde Dehydrogenase  39.34 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  40.18 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  39.65 
 
 		 454 aa  346  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  40.09 
 
 		 463 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  40.22 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  39.07 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.94 
 
 		 455 aa  342  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  38.85 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>