29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28960  sugar phosphate isomerase/epimerase  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3582  xylose isomerase domain-containing protein  44.71 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2282  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.39 
 
 		 236 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1988  petrobactin biosynthesis protein AsbF  28.05 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1849  xylose isomerase domain-containing protein  29.17 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3341  petrobactin biosynthesis protein AsbF  26.83 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.935338  hitchhiker  0.0000000000000165736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1817  hypothetical protein  28.93 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2021  petrobactin biosynthesis protein AsbF  28.93 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84806e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1843  hypothetical protein  28.93 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1986  hypothetical protein  28.93 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1800  hypothetical protein  28.93 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2298  xylose isomerase-like TIM barrel  29.81 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3763  xylose isomerase domain-containing protein  31.52 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3527  xylose isomerase domain-containing protein  31.06 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4058  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.52 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1174  hydroxypyruvate isomerase  28.57 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.970176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2628  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.68 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.52 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72992  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  37.01 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2462  hydroxypyruvate isomerase  30.43 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2809  hydroxypyruvate isomerase  29.06 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4320  hydroxypyruvate isomerase  30 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.35 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.18 
 
 		 287 aa  45.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1567  hydroxypyruvate isomerase  25.11 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2929  hydroxypyruvate isomerase  27.91 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.452433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4554  hydroxypyruvate isomerase  34 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  0.368967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2268  Hydroxypyruvate isomerase  28.24 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>