23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05400 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05400  Protein of unknown function (DUF1524)  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  44.76 
 
 		 772 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  41.84 
 
 		 842 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  33.13 
 
 		 659 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  35.1 
 
 		 656 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  32.17 
 
 		 722 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.61 
 
 		 699 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  30.61 
 
 		 704 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  28.67 
 
 		 697 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  33.11 
 
 		 707 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.05 
 
 		 641 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  32.1 
 
 		 656 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  29.33 
 
 		 697 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  26.39 
 
 		 656 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  28.76 
 
 		 695 aa  50.8  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  27.95 
 
 		 690 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.78 
 
 		 699 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  26.9 
 
 		 689 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  25.6 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.07 
 
 		 726 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.59 
 
 		 700 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  25.15 
 
 		 692 aa  41.6  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  25 
 
 		 687 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>