34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1788 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1788    100 
 
 		 138 bp  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.363185 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  100 
 
 		 852 bp  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4467    100 
 
 		 2251 bp  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0892    96.35 
 
 		 2308 bp  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  87.25 
 
 		 852 bp  99.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  87.25 
 
 		 852 bp  99.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  83.76 
 
 		 501 bp  81.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3764    94.12 
 
 		 552 bp  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 882 bp  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 834 bp  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 882 bp  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 882 bp  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  100 
 
 		 810 bp  48.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 813 bp  48.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0060  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 543 bp  48.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  93.55 
 
 		 816 bp  46.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>