35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6353 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  94.97 
 
 
183 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  82.78 
 
 
178 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  89.17 
 
 
181 aa  255  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  82.8 
 
 
178 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  81.65 
 
 
180 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  72.52 
 
 
171 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  70.99 
 
 
314 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  70.99 
 
 
171 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  54.95 
 
 
171 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  58.9 
 
 
172 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  57.93 
 
 
171 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  42.48 
 
 
179 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  39.04 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5287  hypothetical protein  39.2 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5570  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  32.71 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  41.94 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  35.42 
 
 
230 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  36.73 
 
 
106 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  32.21 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2312  hypothetical protein  31.85 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  34.38 
 
 
210 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2447  hypothetical protein  30.37 
 
 
183 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  35.05 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  29.17 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  29.17 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  29.17 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  31.41 
 
 
209 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  26.47 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0888  hypothetical protein  30.3 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>