13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2920 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2920  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378243  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1007  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0982  hypothetical protein  37.19 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25890  hypothetical protein  30.17 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0812  hypothetical protein  28.06 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  47.76 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  43.48 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1185  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  31.3 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.423386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  39.78 
 
 		 192 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0505  hypothetical protein  32.12 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  43.75 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  39.19 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  37.88 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>