39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2078 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  75.26 
 
 
295 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  55.35 
 
 
273 aa  298  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  52.94 
 
 
285 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  31.36 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  29.75 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.28 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  32.08 
 
 
304 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  27.65 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  28.11 
 
 
303 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
291 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4715  hypothetical protein  29.91 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  31.88 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4801  hypothetical protein  29.91 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  26.85 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  27.91 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 
346 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7793  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5580  aminoglycoside phosphotransferase  31.41 
 
 
345 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
243 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>