More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0421 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0421  ABC transporter related  100 
 
 		 341 aa  672    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  51.34 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  53.73 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04690  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  51.18 
 
 		 420 aa  305  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 		 335 aa  302  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4335  ABC transporter related  48.33 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  50.16 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.14 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0412  ABC transporter related  51.85 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.77 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.7 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  44.57 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 339 aa  292  7e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0698  metal ion ABC transporter ATPase  46.13 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  44.01 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.54 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  44.01 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  44.01 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  43.71 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.63 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.61 
 
 		 344 aa  288  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.62 
 
 		 335 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 335 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.93 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.72 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.83 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.16 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  45.4 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 		 335 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.04 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.59 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.59 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.59 
 
 		 335 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.59 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.72 
 
 		 385 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.72 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 350 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.04 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.52 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  48.8 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  49.85 
 
 		 397 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.75 
 
 		 344 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.75 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.75 
 
 		 349 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 		 343 aa  278  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 		 343 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.95 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 350 aa  275  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1652  ABC transporter related protein  48.08 
 
 		 348 aa  275  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  48.84 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.71 
 
 		 382 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  48.84 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  48.84 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  48.84 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  48.84 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.27 
 
 		 343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.32 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  47.02 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.95 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 		 343 aa  272  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  45.13 
 
 		 340 aa  271  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  42.17 
 
 		 340 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.61 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  44.09 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.78 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 341 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  46.08 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  44.44 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  43.61 
 
 		 340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 343 aa  268  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.97 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  44.04 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>