22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5875 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5875  putative type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 164 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5658  PilS domain-containing protein  96.95 
 
 		 184 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5914  PilS domain-containing protein  51.2 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353424  hitchhiker  0.00844308 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0663  putative type IV pilus biogenesis protein  55.76 
 
 		 196 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.655002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2168  putative type IV pilus protein  55.76 
 
 		 196 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00445151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2252  putative type IV pilus protein  55.76 
 
 		 196 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1984  putative type IV pilus biogenesis protein  55.76 
 
 		 196 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1605  putative type IV pilus biogenesis protein  55.76 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0158393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0651  putative major pilin subunit  55.76 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0774  type IV pilus biogenesis protein, putative  53.37 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406536  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5446  putative type IV pilus biogenesis protein  36.9 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0279047  normal  0.0743907 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5245  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.69 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1760  PilS domain protein  26.32 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2072  putative type IV pilin protein  35.81 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00908282  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2312  putative type IV pilin protein  35.46 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  hitchhiker  0.0000000000000870948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3700  hypothetical protein  32.64 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59320  type IV B pilus protein  30.07 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00129697  hitchhiker  0.00000000000539359 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4208  hypothetical protein  28.97 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4476  type IV B pilus protein  28.67 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0019  type IV prepilin domain-containing protein PilS  32.23 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0112  typeIV prepilin  36.17 
 
 		 204 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4764  hypothetical protein  28.82 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.974143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>