27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5767 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  99.33 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  69.7 
 
 		 298 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  69.02 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  69.02 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  69.02 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  33.77 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  32.46 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.92 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  23.59 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  25.58 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  21.54 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  21.66 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 		 267 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  22.33 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  23.47 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  23.57 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  23.26 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  26.27 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>