45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2385 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  96.09 
 
 		 230 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  87.39 
 
 		 230 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  87.01 
 
 		 231 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  87.01 
 
 		 231 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  87.01 
 
 		 256 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  81.74 
 
 		 230 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  70.43 
 
 		 289 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  65.65 
 
 		 227 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  63.52 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  71.74 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  71.74 
 
 		 227 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  71.74 
 
 		 227 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  71.74 
 
 		 227 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  69.13 
 
 		 264 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  71.3 
 
 		 227 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  70.43 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  57.83 
 
 		 225 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  56.09 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  43.36 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  41.26 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  41.6 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  36.89 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  38.4 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  35.87 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  37 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  40.89 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  40.83 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  33.19 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  39.57 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  36.73 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  36.13 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  35.05 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  38.34 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  34.97 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  37.28 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  36.89 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  46.84 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  46.03 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06030  hypothetical protein  44.83 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34085  predicted protein  24.69 
 
 		 512 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  42.86 
 
 		 274 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>