34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0041 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0051  hypothetical protein  98.85 
 
 		 262 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.356869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3233  hypothetical protein  92.75 
 
 		 274 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830722  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0070  hypothetical protein  91.22 
 
 		 262 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0051  hypothetical protein  90.84 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0019  hypothetical protein  90.84 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0328068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0052  hypothetical protein  87.11 
 
 		 262 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.923907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0019  general secretory pathway protein N  73.64 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.470521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1879  general secretory pathway protein N  73.64 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174297  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0019  general secretory pathway protein N  73.64 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2673  general secretory pathway protein N  73.64 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3507  general secretory pathway protein N  73.64 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0018  general secretory pathway protein N  75.39 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0231  general secretory pathway protein N  73.64 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2774  general secretory pathway protein N  73.64 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3081  type II secretion system protein N  65.22 
 
 		 259 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173881  hitchhiker  0.000000265494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4490  putative general secretory pathway protein N  62.85 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3947  putative general secretory pathway protein N  61.26 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506993  normal  0.535358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3228  general secretory pathway N transmembrane protein  50 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3391  type II secretion system protein N  43.15 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3051  general secretory pathway N transmembrane protein  46.88 
 
 		 280 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3398  putative general secretory pathway N transmembrane protein  45.42 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3113  general secretory pathway N transmembrane protein  47.56 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0918  type II secretion system protein N  41.87 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.339079  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5696  putative general secretory pathway N transmembrane protein  40.61 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86222  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3528  putative general secretory pathway N transmembrane protein  39.44 
 
 		 267 aa  131  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0757  putative general secretory pathway N transmembrane protein  39.36 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0647  putative general secretory pathway N transmembrane protein  38.89 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0363595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0668  putative general secretory pathway N transmembrane protein  38.89 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3135  general secretion pathway protein N  38.24 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1328  putative general secretory pathway N transmembrane protein  36.4 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1074  putative general secretory pathway N transmembrane protein  33.62 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0541  putative general secretory pathway N transmembrane protein  34.78 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3426  general secretion pathway protein N  34.67 
 
 		 319 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000290078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>