50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2938 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  94.52 
 
 
146 aa  274  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  94.52 
 
 
146 aa  274  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  94.52 
 
 
146 aa  274  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  91.1 
 
 
146 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3023  FlgN family protein  89.73 
 
 
146 aa  237  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0459  flagella synthesis protein FlgN, putative  76.71 
 
 
164 aa  224  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3358  putative flagella synthesis protein FlgN  76.71 
 
 
164 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2990  putative flagella synthesis protein FlgN  76.71 
 
 
164 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2103  putative flagella synthesis protein FlgN  76.71 
 
 
164 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0263  FlgN family flagellar protein  76.71 
 
 
164 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0275  FlgN family flagellar protein  76.71 
 
 
164 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  76.03 
 
 
146 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3321  flagella synthesis protein FlgN, putative  76.71 
 
 
146 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2945  FlgN family protein  56.85 
 
 
148 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3797  FlgN family protein  59.03 
 
 
148 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0137  putative flagella synthesis protein  58.33 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23970  Flagella synthesis protein  37.98 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2328  flagella synthesis protein FlgN  32.62 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.832772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2428  FlgN family protein  32.62 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5622  FlgN  30.56 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4202  FlgN family protein  33.33 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1316  FlgN  32.12 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1981  FlgN  33.33 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2973  FlgN family protein  30.77 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337654  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3731  flagella synthesis protein FlgN  28.57 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1283  flagella synthesis protein FlgN  30.61 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.822571  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1268  flagella synthesis protein FlgN  30.61 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1239  flagella synthesis protein FlgN  30.61 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2017  flagella synthesis protein FlgN  30.61 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2201  flagella synthesis protein FlgN  30.61 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  25.55 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2601  FlgN family protein  28.43 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.284487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1550  FlgN family protein  33.33 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  27.78 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2530  FlgN family protein  28.7 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382364  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1193  flagella synthesis protein FlgN  28.7 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2256  flagella synthesis protein FlgN  28.7 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2059  flagella synthesis protein FlgN  28.7 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168753 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0339  flagella synthesis protein FLGN  32.12 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460726  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  27.78 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1584  FlgN family protein  29.73 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01074  hypothetical protein  28.7 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.482353  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2576  FlgN family protein  28.7 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01066  export chaperone for FlgK and FlgL  28.7 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.638525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1449  flagella synthesis protein FlgN  28.7 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1193  flagella synthesis protein FlgN  28.7 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1865  FlgN family protein  27.36 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0746  FlgN  26.43 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>