14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0339 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0339  flagella synthesis protein FLGN  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4794  FlgN family protein  86.93 
 
 		 153 aa  271  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.295932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3717  FlgN family protein  86.93 
 
 		 153 aa  271  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.280332  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  30.56 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  32.12 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  32.12 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  32.12 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  29.86 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  32.12 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  32.12 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1316  FlgN  33.56 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  31.39 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  27.78 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  28.39 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>