26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1458 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  86.45 
 
 		 155 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  83.23 
 
 		 155 aa  260  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  83.23 
 
 		 155 aa  257  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  58.71 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  53.55 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  51.61 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  44.52 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  42.38 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  40.38 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  31.58 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  30.88 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0921  FlgN family protein  25.53 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2103  putative flagella synthesis protein FlgN  28 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0078  hypothetical protein  29.41 
 
 		 152 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3358  putative flagella synthesis protein FlgN  28 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0275  FlgN family flagellar protein  28 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2990  putative flagella synthesis protein FlgN  28 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0459  flagella synthesis protein FlgN, putative  28 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0263  FlgN family flagellar protein  28 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3321  flagella synthesis protein FlgN, putative  28 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  30.23 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0339  flagella synthesis protein FLGN  28.39 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0525  FlgN family protein  28.17 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1065  FlgN family protein  24.14 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0193453  normal  0.0784945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1173  FlgN family protein  22.39 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>