29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3737 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  100 
 
 
155 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  86.45 
 
 
155 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  79.35 
 
 
155 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  79.35 
 
 
155 aa  246  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  56.77 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  50.97 
 
 
155 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  49.03 
 
 
155 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  41.29 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  41.06 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  39.74 
 
 
156 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  32.35 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  30.08 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0921  FlgN family protein  26.24 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2103  putative flagella synthesis protein FlgN  30.23 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0275  FlgN family flagellar protein  30.23 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3358  putative flagella synthesis protein FlgN  30.23 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2990  putative flagella synthesis protein FlgN  30.23 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  31.16 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3321  flagella synthesis protein FlgN, putative  30.23 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0525  FlgN family protein  34.34 
 
 
175 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1173  FlgN family protein  23.88 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0072  hypothetical protein  27.54 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0459  flagella synthesis protein FlgN, putative  30.23 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3374  hypothetical protein  30.43 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  29.13 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0263  FlgN family flagellar protein  30.23 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  25.17 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  25.17 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  25.17 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>