15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4256 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  100 
 
 		 155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  60.65 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  59.35 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  59.35 
 
 		 155 aa  183  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  60 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  58.71 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  56.77 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  47.74 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  42.67 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  30.88 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0260  lateral flagellar chaperone protein LfgN  31.43 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  28.28 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  28.28 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  28.28 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>