43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2601 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2601  FlgN family protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.284487  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1865  FlgN family protein  88.97 
 
 		 145 aa  266  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1550  FlgN family protein  52.27 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2428  FlgN family protein  48.95 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2328  flagella synthesis protein FlgN  48.95 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.832772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2973  FlgN family protein  44.76 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1584  FlgN family protein  40.69 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1522  FlgN family protein  34.75 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2201  flagella synthesis protein FlgN  39.69 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2017  flagella synthesis protein FlgN  39.69 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1239  flagella synthesis protein FlgN  39.69 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1268  flagella synthesis protein FlgN  39.69 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1283  flagella synthesis protein FlgN  39.69 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.822571  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1193  flagella synthesis protein FlgN  37.93 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2576  FlgN family protein  37.24 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01066  export chaperone for FlgK and FlgL  37.24 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.638525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01074  hypothetical protein  37.24 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.482353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1193  flagella synthesis protein FlgN  37.24 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2256  flagella synthesis protein FlgN  37.24 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2530  FlgN family protein  36.55 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382364  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2059  flagella synthesis protein FlgN  36.99 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1449  flagella synthesis protein FlgN  36.55 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161406 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3321  flagella synthesis protein FlgN, putative  30.08 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2103  putative flagella synthesis protein FlgN  30.08 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0275  FlgN family flagellar protein  30.08 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3358  putative flagella synthesis protein FlgN  30.08 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2990  putative flagella synthesis protein FlgN  30.08 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0459  flagella synthesis protein FlgN, putative  30.08 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0263  FlgN family flagellar protein  30.08 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  29.66 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23970  Flagella synthesis protein  26.77 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  28.97 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  28.97 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  28.97 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1981  FlgN  24.46 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3797  FlgN family protein  29.13 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  28.04 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0137  putative flagella synthesis protein  28.16 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  28.43 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  28.43 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2945  FlgN family protein  28.93 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5622  FlgN  35.85 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2685  FlgN  27.78 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.742379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>