39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1865 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1865  FlgN family protein  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2601  FlgN family protein  88.97 
 
 
145 aa  266  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.284487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2428  FlgN family protein  49.65 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2328  flagella synthesis protein FlgN  49.65 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.832772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1550  FlgN family protein  47.73 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2973  FlgN family protein  46.15 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337654  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1584  FlgN family protein  41.38 
 
 
140 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2576  FlgN family protein  40.41 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01074  hypothetical protein  40.41 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.482353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2201  flagella synthesis protein FlgN  41.98 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2017  flagella synthesis protein FlgN  41.98 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1239  flagella synthesis protein FlgN  41.98 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1268  flagella synthesis protein FlgN  41.98 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2256  flagella synthesis protein FlgN  40 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01066  export chaperone for FlgK and FlgL  40.41 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.638525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1193  flagella synthesis protein FlgN  40 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1193  flagella synthesis protein FlgN  40 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2059  flagella synthesis protein FlgN  40.41 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1283  flagella synthesis protein FlgN  41.22 
 
 
130 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.822571  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2530  FlgN family protein  39.31 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382364  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1449  flagella synthesis protein FlgN  39.73 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1522  FlgN family protein  33.33 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  28.69 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3321  flagella synthesis protein FlgN, putative  31.36 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  28.69 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  28.69 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0275  FlgN family flagellar protein  31.36 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2103  putative flagella synthesis protein FlgN  31.36 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2990  putative flagella synthesis protein FlgN  31.36 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0459  flagella synthesis protein FlgN, putative  31.36 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3358  putative flagella synthesis protein FlgN  31.36 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  30.51 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0263  FlgN family flagellar protein  31.36 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23970  Flagella synthesis protein  25.98 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1981  FlgN  24.46 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  28.04 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  27.36 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  27.36 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2945  FlgN family protein  26.77 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>