30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2530 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2530  FlgN family protein  100 
 
 
138 aa  279  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382364  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2256  flagella synthesis protein FlgN  99.28 
 
 
138 aa  277  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1193  flagella synthesis protein FlgN  99.28 
 
 
138 aa  277  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2576  FlgN family protein  98.55 
 
 
138 aa  276  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01074  hypothetical protein  98.55 
 
 
138 aa  276  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.482353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01066  export chaperone for FlgK and FlgL  98.55 
 
 
138 aa  276  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.638525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2059  flagella synthesis protein FlgN  97.83 
 
 
138 aa  276  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1449  flagella synthesis protein FlgN  97.83 
 
 
138 aa  275  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1193  flagella synthesis protein FlgN  98.55 
 
 
138 aa  275  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1584  FlgN family protein  72.86 
 
 
140 aa  203  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2201  flagella synthesis protein FlgN  77.69 
 
 
130 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2017  flagella synthesis protein FlgN  77.69 
 
 
130 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1239  flagella synthesis protein FlgN  77.69 
 
 
130 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1268  flagella synthesis protein FlgN  77.69 
 
 
130 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1283  flagella synthesis protein FlgN  76.92 
 
 
130 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.822571  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2328  flagella synthesis protein FlgN  43.48 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.832772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2428  FlgN family protein  43.48 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1865  FlgN family protein  39.31 
 
 
145 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1550  FlgN family protein  38.93 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2973  FlgN family protein  38.36 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337654  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2601  FlgN family protein  36.55 
 
 
145 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.284487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1522  FlgN family protein  31.69 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1981  FlgN  29.25 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  26.87 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  28.7 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  28.7 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  28.7 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  28.7 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  28.7 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  37.93 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>