30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01066 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2576  FlgN family protein  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01074  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.482353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01066  export chaperone for FlgK and FlgL  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.638525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2256  flagella synthesis protein FlgN  99.28 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1193  flagella synthesis protein FlgN  99.28 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2530  FlgN family protein  98.55 
 
 		 138 aa  276  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382364  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2059  flagella synthesis protein FlgN  98.55 
 
 		 138 aa  276  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1449  flagella synthesis protein FlgN  98.55 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1193  flagella synthesis protein FlgN  98.55 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1584  FlgN family protein  74.29 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2201  flagella synthesis protein FlgN  79.23 
 
 		 130 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2017  flagella synthesis protein FlgN  79.23 
 
 		 130 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1239  flagella synthesis protein FlgN  79.23 
 
 		 130 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1268  flagella synthesis protein FlgN  79.23 
 
 		 130 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1283  flagella synthesis protein FlgN  78.46 
 
 		 130 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.822571  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1865  FlgN family protein  40.41 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45584  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2428  FlgN family protein  44.2 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2328  flagella synthesis protein FlgN  44.2 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.832772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1550  FlgN family protein  38.93 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2973  FlgN family protein  39.04 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2601  FlgN family protein  37.24 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.284487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1522  FlgN family protein  30.99 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1981  FlgN  30.15 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  26.87 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  28.7 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  28.7 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  28.7 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  28.7 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  28.7 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  37.93 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>