31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2201 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1268  flagella synthesis protein FlgN  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1239  flagella synthesis protein FlgN  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2201  flagella synthesis protein FlgN  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2017  flagella synthesis protein FlgN  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1283  flagella synthesis protein FlgN  99.23 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.822571  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1584  FlgN family protein  86.15 
 
 		 140 aa  227  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2576  FlgN family protein  79.23 
 
 		 138 aa  203  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.526309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01074  hypothetical protein  79.23 
 
 		 138 aa  203  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.482353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01066  export chaperone for FlgK and FlgL  79.23 
 
 		 138 aa  203  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.638525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1193  flagella synthesis protein FlgN  78.46 
 
 		 138 aa  202  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1193  flagella synthesis protein FlgN  78.46 
 
 		 138 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2059  flagella synthesis protein FlgN  78.46 
 
 		 138 aa  201  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2256  flagella synthesis protein FlgN  78.46 
 
 		 138 aa  202  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2530  FlgN family protein  77.69 
 
 		 138 aa  200  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382364  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1449  flagella synthesis protein FlgN  77.69 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2973  FlgN family protein  45.8 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1865  FlgN family protein  41.98 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1550  FlgN family protein  41.22 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2428  FlgN family protein  43.94 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2328  flagella synthesis protein FlgN  43.94 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.832772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2601  FlgN family protein  39.69 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.284487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1522  FlgN family protein  33.59 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1981  FlgN  34.43 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  31.63 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  31.82 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  31.82 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  31.82 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23970  Flagella synthesis protein  30.95 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  30.61 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  30.61 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4202  FlgN family protein  23.24 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>