43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4202 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4202  FlgN family protein  100 
 
 		 148 aa  294  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  36.15 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  36.15 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  36.15 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3797  FlgN family protein  34.31 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23970  Flagella synthesis protein  33.57 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  35.38 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  35.38 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  35.77 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  35.38 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0137  putative flagella synthesis protein  34.06 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3023  FlgN family protein  35.66 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2103  putative flagella synthesis protein FlgN  34.62 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3358  putative flagella synthesis protein FlgN  34.62 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0275  FlgN family flagellar protein  34.62 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3321  flagella synthesis protein FlgN, putative  34.62 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0459  flagella synthesis protein FlgN, putative  34.62 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2990  putative flagella synthesis protein FlgN  34.62 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0263  FlgN family flagellar protein  34.62 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2945  FlgN family protein  29.71 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0746  FlgN  31.25 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5622  FlgN  33.11 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3731  flagella synthesis protein FlgN  33.55 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  31.21 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  29.41 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1640  putative flagella synthesis protein FlgN  33.9 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0347725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2017  flagella synthesis protein FlgN  24.82 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1268  flagella synthesis protein FlgN  24.82 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1239  flagella synthesis protein FlgN  24.82 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2201  flagella synthesis protein FlgN  24.82 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1584  FlgN family protein  24.67 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  27.21 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2428  FlgN family protein  24.46 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.150088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1283  flagella synthesis protein FlgN  24.82 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.822571  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2328  flagella synthesis protein FlgN  24.46 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.832772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1316  FlgN  30.15 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1522  FlgN family protein  32.31 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2601  FlgN family protein  26.09 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.284487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  27.13 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2973  FlgN family protein  33.33 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1865  FlgN family protein  26.09 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  26.36 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1550  FlgN family protein  26.09 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>