26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3731 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3731  flagella synthesis protein FlgN  100 
 
 
154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5622  FlgN  59.09 
 
 
153 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6374  FlgN  30 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1316  FlgN  31.51 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0237  flagella synthesis protein FlgN, putative  27.78 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3321  flagella synthesis protein FlgN, putative  27.78 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0263  FlgN family flagellar protein  27.78 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0459  flagella synthesis protein FlgN, putative  27.78 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3358  putative flagella synthesis protein FlgN  27.78 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0275  FlgN family flagellar protein  27.78 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2990  putative flagella synthesis protein FlgN  27.78 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2103  putative flagella synthesis protein FlgN  27.78 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3797  FlgN family protein  28.37 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2938  FlgN family protein  28.57 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.04442  normal  0.386188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4202  FlgN family protein  32.45 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3073  FlgN family protein  28.57 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0746  FlgN  28.06 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  27.86 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  27.86 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  27.86 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2945  FlgN family protein  26.57 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0137  putative flagella synthesis protein  26.24 
 
 
148 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3023  FlgN family protein  29.29 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1640  putative flagella synthesis protein FlgN  25.97 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0347725  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1584  FlgN family protein  30.3 
 
 
140 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  29.03 
 
 
157 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>