30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0657 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0749  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0657  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2038  putative metallo-beta lactamase-related protein  100 
 
 
296 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1931  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  89.93 
 
 
298 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258843  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5767  beta-lactamase domain-containing protein  69.7 
 
 
298 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5527  beta-lactamase domain-containing protein  69.36 
 
 
298 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  32.31 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  31.97 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.92 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  21.36 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  29.87 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  24.74 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  23.17 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
237 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  25 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
214 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  22.02 
 
 
226 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  22.92 
 
 
884 aa  43.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>