24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1600 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1600  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 295 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1760  hypothetical protein  97.18 
 
 		 721 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1371  outer membrane efflux protein  96.43 
 
 		 269 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0644375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0503  putative outer membrane protein  96.43 
 
 		 269 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  63.32 
 
 		 519 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  63.18 
 
 		 515 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  60.2 
 
 		 514 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  60.7 
 
 		 514 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  60.2 
 
 		 514 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  60.2 
 
 		 514 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  60.7 
 
 		 513 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  54.05 
 
 		 517 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  54.19 
 
 		 520 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  53.96 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  51.93 
 
 		 508 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  45.81 
 
 		 527 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  41.11 
 
 		 521 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  34.33 
 
 		 453 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  34.33 
 
 		 453 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  34.33 
 
 		 508 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.07 
 
 		 490 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.63 
 
 		 455 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  27.09 
 
 		 452 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  27.09 
 
 		 456 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>