21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0168 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  100 
 
 		 116 aa  236  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  38.24 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  48.15 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.97 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  35.4 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  32.32 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23030  LysM domain-containing protein  38.6 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  34.09 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  31.87 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  39.34 
 
 		 409 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  31.15 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 503 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  29.07 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2432  Peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 116 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  24.64 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.82 
 
 		 213 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10630  LysM domain-containing protein  39.58 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  32.65 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 427 aa  40  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>