More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0089 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  100 
 
 		 751 aa  1538    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  43.93 
 
 		 640 aa  640    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  45.66 
 
 		 882 aa  658    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  44.39 
 
 		 885 aa  635  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  55.72 
 
 		 642 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  52.07 
 
 		 888 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  50.58 
 
 		 880 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  45.99 
 
 		 646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  44.69 
 
 		 646 aa  297  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  28.13 
 
 		 691 aa  236  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  27.95 
 
 		 694 aa  233  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.2 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27.32 
 
 		 691 aa  230  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  27.91 
 
 		 691 aa  230  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  27.78 
 
 		 691 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  27.96 
 
 		 691 aa  229  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  27.16 
 
 		 691 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  26.93 
 
 		 691 aa  227  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  27.31 
 
 		 692 aa  227  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.44 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  27.17 
 
 		 698 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  26.84 
 
 		 691 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  28.24 
 
 		 697 aa  223  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.41 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.41 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  26.7 
 
 		 689 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  29.1 
 
 		 656 aa  222  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  27.06 
 
 		 698 aa  221  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  26.17 
 
 		 697 aa  221  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  27.37 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  27.41 
 
 		 698 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  27.41 
 
 		 698 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  27.41 
 
 		 698 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  26.55 
 
 		 692 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  27.41 
 
 		 700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  26.03 
 
 		 691 aa  217  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  27.04 
 
 		 692 aa  218  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  26.91 
 
 		 697 aa  216  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  26.82 
 
 		 697 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  27.41 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  27.41 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  27.41 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  27.03 
 
 		 697 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  27.41 
 
 		 698 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  27.66 
 
 		 698 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  26.57 
 
 		 692 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  26.71 
 
 		 708 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  26.65 
 
 		 692 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.72 
 
 		 706 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  27.38 
 
 		 698 aa  214  5.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.99 
 
 		 692 aa  214  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  26.15 
 
 		 693 aa  214  7e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.93 
 
 		 697 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  26.46 
 
 		 708 aa  213  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  26.21 
 
 		 697 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  27.03 
 
 		 698 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  27.39 
 
 		 700 aa  213  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  26.7 
 
 		 692 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  25.54 
 
 		 695 aa  213  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  25.51 
 
 		 695 aa  212  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  26.09 
 
 		 696 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  26.21 
 
 		 697 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_415  translation elongation factor G  25.9 
 
 		 693 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000373207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  26.64 
 
 		 691 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.84 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.54 
 
 		 696 aa  211  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  26.76 
 
 		 692 aa  211  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  25.86 
 
 		 699 aa  211  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000439347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  26.09 
 
 		 697 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  25.64 
 
 		 693 aa  211  6e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  25.03 
 
 		 690 aa  210  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  26.83 
 
 		 689 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  26.63 
 
 		 690 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  26.96 
 
 		 699 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  26.56 
 
 		 700 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  26.89 
 
 		 700 aa  209  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  27.22 
 
 		 699 aa  209  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  25.61 
 
 		 699 aa  209  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  26.59 
 
 		 695 aa  209  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  26.73 
 
 		 692 aa  208  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  25.61 
 
 		 699 aa  208  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  26.25 
 
 		 695 aa  207  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  25.77 
 
 		 704 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  26.85 
 
 		 706 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.53 
 
 		 715 aa  207  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  26.25 
 
 		 692 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  25.74 
 
 		 692 aa  206  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  26.75 
 
 		 700 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  24.45 
 
 		 693 aa  205  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  25.98 
 
 		 698 aa  206  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  25.98 
 
 		 699 aa  206  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2171  elongation factor G  26.77 
 
 		 684 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  26.02 
 
 		 699 aa  205  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  25.84 
 
 		 691 aa  205  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  25.03 
 
 		 673 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0612  elongation factor G  26.32 
 
 		 688 aa  204  6e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  26.06 
 
 		 691 aa  204  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  25.55 
 
 		 692 aa  204  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  26.54 
 
 		 696 aa  204  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  26.06 
 
 		 691 aa  203  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>