More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5902 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5902  putative iron-sulfur cluster assembly protein  100 
 
 
109 aa  219  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0113  HesB/YadR/YfhF-family protein  71.84 
 
 
104 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  61.76 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3644  HesB/YadR/YfhF-family protein  57.66 
 
 
118 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0398  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.78 
 
 
118 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770041  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  57.58 
 
 
118 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.67 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  55.56 
 
 
135 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5109  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.55 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1065  HesB/YadR/YfhF  52.53 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  56.25 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  56.25 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.64 
 
 
134 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4470  HesB/YadR/YfhF  51.52 
 
 
118 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.71 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.71 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  41.18 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.56 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  39.56 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  36.46 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.21 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.63 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.63 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.76 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  36.46 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  33.33 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.95 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  32.29 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  36.46 
 
 
168 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  32.29 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.42 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  36.08 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  42.67 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  35.35 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1694  FeS assembly scaffold SufA  32.26 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.894129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.46 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  36.84 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.42 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  34.31 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.95 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.96 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.13 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  32 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.74 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  36.26 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.79 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  33.68 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.74 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.74 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.68 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.36 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  33.68 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.29 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.46 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  34.74 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.82 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.56 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.74 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.74 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.74 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.35 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.41 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  35.79 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.05 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  35.29 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.42 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.46 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.79 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.42 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.46 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.58 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1885  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35.05 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1958  FeS assembly scaffold SufA  35.05 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.77 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2398  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35.05 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029716 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1512  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35.05 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613929  hitchhiker  0.00000225321 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1900  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35.05 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00343676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  30.85 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.79 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  35.16 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  27.08 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.53 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1765  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  35.05 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.718916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.03 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  32.63 
 
 
107 aa  59.3  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  35.05 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  36.73 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.29 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  34.74 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>