More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0979 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  58.53 
 
 		 686 aa  803    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  65.88 
 
 		 680 aa  914    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  66.77 
 
 		 680 aa  930    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  73.12 
 
 		 679 aa  1008    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  69.76 
 
 		 690 aa  952    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  56.05 
 
 		 682 aa  752    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  69.62 
 
 		 690 aa  949    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  70.8 
 
 		 679 aa  970    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  53.51 
 
 		 714 aa  733    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  60.92 
 
 		 687 aa  811    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  66.32 
 
 		 738 aa  915    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  53.08 
 
 		 802 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  100 
 
 		 678 aa  1390    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  67.07 
 
 		 686 aa  863    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  53.73 
 
 		 716 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  56.23 
 
 		 678 aa  731    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  60.83 
 
 		 683 aa  801    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  59.32 
 
 		 692 aa  813    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  54.45 
 
 		 685 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  66.32 
 
 		 680 aa  923    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  62.43 
 
 		 681 aa  833    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  66.52 
 
 		 684 aa  914    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  72.53 
 
 		 679 aa  961    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  59.59 
 
 		 691 aa  806    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  56.63 
 
 		 704 aa  782    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  66.47 
 
 		 682 aa  877    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  53.3 
 
 		 689 aa  724    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  68.54 
 
 		 699 aa  924    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  66.32 
 
 		 680 aa  923    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  68.88 
 
 		 690 aa  937    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  64.26 
 
 		 681 aa  884    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  66.32 
 
 		 680 aa  923    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  66.57 
 
 		 680 aa  921    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  46.12 
 
 		 642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  45.45 
 
 		 645 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  44.26 
 
 		 652 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  41.46 
 
 		 635 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  41.07 
 
 		 647 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  42.1 
 
 		 635 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  40.48 
 
 		 647 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  41.76 
 
 		 676 aa  474  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  64.62 
 
 		 846 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  40.87 
 
 		 644 aa  440  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  31.19 
 
 		 650 aa  291  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  30.38 
 
 		 600 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.51 
 
 		 587 aa  194  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.95 
 
 		 566 aa  185  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  27 
 
 		 573 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  28.01 
 
 		 576 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.06 
 
 		 566 aa  179  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  28.01 
 
 		 576 aa  178  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.85 
 
 		 566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.47 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.11 
 
 		 577 aa  161  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  30.86 
 
 		 554 aa  161  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  25.67 
 
 		 583 aa  159  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  29.31 
 
 		 567 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.57 
 
 		 542 aa  153  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  26.87 
 
 		 559 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  28.69 
 
 		 599 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.39 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.75 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.83 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  28.22 
 
 		 552 aa  146  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  27.61 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.59 
 
 		 577 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  25.92 
 
 		 591 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  28.49 
 
 		 541 aa  145  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  28.6 
 
 		 574 aa  144  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.16 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.72 
 
 		 567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  28.92 
 
 		 567 aa  141  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  27.35 
 
 		 543 aa  140  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  24.6 
 
 		 560 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  27.9 
 
 		 571 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  25.89 
 
 		 552 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  27.6 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  26.57 
 
 		 598 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  26.36 
 
 		 566 aa  137  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  25.13 
 
 		 540 aa  137  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  27.57 
 
 		 570 aa  137  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  27.2 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  28.25 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  27.24 
 
 		 584 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  27 
 
 		 562 aa  135  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  28.86 
 
 		 571 aa  135  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  26.09 
 
 		 567 aa  134  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  27.6 
 
 		 564 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  24.22 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  26.94 
 
 		 565 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  27.57 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  25.83 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  26.49 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  24.22 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  27.94 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  25.48 
 
 		 545 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  25.17 
 
 		 561 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  28.65 
 
 		 550 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  25.17 
 
 		 561 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  25.67 
 
 		 552 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>