24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0876 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0031  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0048  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3069    96.88 
 
 
627 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0504    96.88 
 
 
435 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0649  hypothetical protein  96.88 
 
 
627 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1218  hypothetical protein  96.88 
 
 
501 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0026  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 
86 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  96.77 
 
 
88 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  90.7 
 
 
88 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0049  tRNA-Gly  96.67 
 
 
86 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.459063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  84.93 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  84.93 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  84.93 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0035  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t18  tRNA-Leu  96.43 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  85.71 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>