23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  76.42 
 
 
254 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  65.43 
 
 
248 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  31.75 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  26.75 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.94 
 
 
265 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  31.17 
 
 
291 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  25.2 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.96448 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  26.64 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.51 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3882  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.64 
 
 
316 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.66 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4291  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768116  hitchhiker  0.00438427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.53 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.69 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.78 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.63 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41583  predicted protein  25 
 
 
432 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.531916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6528  Phytanoyl-CoA dioxygenase  41.03 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.45 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2960  hypothetical protein  34.62 
 
 
275 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0605457  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>