30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8284 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8284    100 
 
 		 564 bp  1118    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  88.5 
 
 		 813 bp  121  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0933    81.08 
 
 		 3322 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.128492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0169    81.08 
 
 		 2186 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.645722  decreased coverage  0.00366507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  81.08 
 
 		 825 bp  109  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  86.36 
 
 		 798 bp  99.6  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  89.53 
 
 		 438 bp  99.6  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3010    85.84 
 
 		 825 bp  97.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  84.07 
 
 		 798 bp  81.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0908    86.84 
 
 		 432 bp  71.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.828135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  88.06 
 
 		 843 bp  69.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  87.14 
 
 		 825 bp  67.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  87.14 
 
 		 825 bp  67.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  87.14 
 
 		 825 bp  67.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  87.14 
 
 		 825 bp  67.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  87.14 
 
 		 825 bp  67.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  87.14 
 
 		 825 bp  67.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  85.71 
 
 		 825 bp  60  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4119  transposase (IS12528)  89.36 
 
 		 477 bp  54  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 837 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0934    96.55 
 
 		 699 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3369    96.55 
 
 		 837 bp  50.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>