21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3369 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  88.77 
 
 
837 bp  914    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3369    100 
 
 
837 bp  1659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0934    91.68 
 
 
699 bp  906    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3092    94.94 
 
 
288 bp  406  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1254    81.82 
 
 
147 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2390    88 
 
 
2187 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1748    88 
 
 
2896 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143387  normal  0.630182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  88 
 
 
837 bp  52  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8062    86.79 
 
 
704 bp  50.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.10988  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8284    96.55 
 
 
564 bp  50.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>