34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2390 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2390    100 
 
 		 2187 bp  4335    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1748    100 
 
 		 2896 bp  886    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143387  normal  0.630182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  90.12 
 
 		 1254 bp  1287    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  100 
 
 		 837 bp  1659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  96 
 
 		 837 bp  83.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  83.84 
 
 		 825 bp  69.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0714    83.84 
 
 		 645 bp  69.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000440165  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  90.57 
 
 		 822 bp  65.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  90.57 
 
 		 822 bp  65.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0934    90.57 
 
 		 699 bp  65.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550066  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  97.22 
 
 		 1287 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8062    85.92 
 
 		 704 bp  61.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.10988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  83.72 
 
 		 831 bp  60  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  97.06 
 
 		 1254 bp  60  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  94.44 
 
 		 1272 bp  56  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2231    88.24 
 
 		 772 bp  54  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00103986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  88 
 
 		 1272 bp  52  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3369    88 
 
 		 837 bp  52  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  91.89 
 
 		 1254 bp  50.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  91.89 
 
 		 753 bp  50.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0393  transposase (class IV)  96.55 
 
 		 216 bp  50.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  90.24 
 
 		 885 bp  50.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  90.24 
 
 		 813 bp  50.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>