25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0934 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3369    91.68 
 
 		 837 bp  906    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0934    100 
 
 		 699 bp  1386    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  89.19 
 
 		 837 bp  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3092    92.66 
 
 		 288 bp  153  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  93.33 
 
 		 822 bp  65.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2390    90.57 
 
 		 2187 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1748    90.57 
 
 		 2896 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143387  normal  0.630182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  90.57 
 
 		 837 bp  65.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  93.33 
 
 		 822 bp  65.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0393  transposase (class IV)  89.58 
 
 		 216 bp  56  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  92.11 
 
 		 828 bp  52  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8284    96.55 
 
 		 564 bp  50.1  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  91.67 
 
 		 885 bp  48.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8062    93.75 
 
 		 704 bp  48.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.10988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>