32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8062 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8062    100 
 
 		 704 bp  1396    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.10988  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  86.49 
 
 		 822 bp  67.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  93.48 
 
 		 831 bp  67.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  86.49 
 
 		 822 bp  67.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 813 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2390    85.92 
 
 		 2187 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1748    85.92 
 
 		 2896 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143387  normal  0.630182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 813 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  85.92 
 
 		 837 bp  61.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 813 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 813 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 813 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 813 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 813 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 675 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  84.34 
 
 		 813 bp  61.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  91.11 
 
 		 825 bp  58  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0714    91.11 
 
 		 645 bp  58  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000440165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  88 
 
 		 837 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3369    86.79 
 
 		 837 bp  50.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0934    93.75 
 
 		 699 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.550066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>